医院首批市级医学重点专科，在建省级医学重点专科。四川大学华西医院乳腺疾病和肝胆外科联盟单位，西部肝胆胰脾微创技术联盟单位。科室技术力量雄厚，人才梯队合理，有主任医师1人，副主任医师2人，主治医师5人，医学硕士2人。分肝胆胰脾、甲状腺乳腺、胃肠疝、血管外科四个亚专业组。以腹腔镜、内镜、介入微创手术为专科特色。特色技术代表有：三入路胆系结石微创治疗（Select理念） 上入路B超引导下肝内胆管穿刺取石术（PTCL）、中入路经腹腔镜联合胆道镜胆总管切开取石术（LCBDE）、下入路通过十二指肠镜取石术（ERCP）。

腹腔镜微创手术主要开展：腹腔镜肝切除、脾切除、胆囊切除、肝囊肿去顶、直肠癌根治低位保肛、胃穿孔修补、阑尾切除、小儿疝囊高位结扎、疝修补术（TAPP）、双镜联合胆总管切开取石、保胆取石。内镜微创手术（十二指肠镜下及胆道镜技术）主要开展：十二指肠镜取石术（EST）、急性胰腺炎鼻胆管引流术（ENBD）、壶腹部肿瘤支架植入术（ERBD）、胆道镜下胆管残余结石清除等。介入微创手术主要开展: 硬质胆道镜经皮经肝穿刺胆管治疗肝内外胆管结石（PTCL）、晚期肝门胆管癌穿刺引流（PTCD）、肝脓肿穿刺引流、腹腔残余脓肿穿刺引流、急性胰腺炎的内镜介入微创治疗等；外周围血管介入治疗方面，如：晚期肝癌、复发性肝癌、上消化道大出血及肝癌破裂出血的介入治疗。传统手术主要开展：左右半肝切除、门奇断流、胰十二指肠切除、甲状腺癌根治、乳腺癌根治、大隐静脉高位结扎及各种肛门疾病手术等。

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